MailGates防毒模組，並非一般傳統利用外部呼叫的方式，採取從核心整合的架構，除了可大幅提高掃毒效率外，更可與電子郵件防護系統做密切的整合。若有購買Sophos防毒模組，系統才會有此功能選單。點選「防毒與 APT 防護 > 防毒模組」，即可看到主畫面顯示防毒引擎狀態與病毒碼狀態。

防毒模組啟用後，當信件經由MailGates傳送至後端郵件伺服器時，防毒模組即可進行 SMTP 即時病毒掃描。當信件掃毒發現有任何病毒存在，可發信通知使用者，並將其中毒的病毒名稱，原來寄信人、寄信標題、寄信時間資訊附在通知信件上。並於通知信件中，有詳細「病毒信件--」說明文字。

病毒信件通知範例